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高通量基因测序是什么意思
1、高通量测序原理是将基因组DNA片断化,然后克隆到质粒载体上,再转化大肠杆菌。对于每个测序反应,挑出单克隆,并纯化质粒DNA。
2、高通量测序技术 (High-throughput sequencing)又称“下一代”测序技术(Next-generation sequencing technology),或大规模平行测序(Massively parallel sequencing,MPS)。
3、不过到2005年以后,高通量测序就改指第二代测序(Next generation sequencing),45Solexa(后改为Illumina)和SOLiD等第二代测序,比3730等第一代测序的通量提高了成千上万倍,甚至上亿倍,所以称为高通量测序。
4、高通量测序技术(High-throughput sequencing)又称“下一代”测序技术(Next-generation sequencing technology)简称“Ngs”,以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。
5、所谓的NGS即Next-generation sequencing,翻译为“下一代测序技术”,或者是“第二代测序技术”,也叫高通量测序技术。
一代测序、二代测序和三代测序各有什么优势?
1、二代测序优点是相比一代测序大幅降低了成本,保持了较高准确性,并且大幅降低了测序时间,将一个人类基因组从3年降为1周以内。缺点是序列读长方面比第一代测序技术要短很多。
2、二代测序技术虽然通量很高,成本低廉,但是读长实在太短,主流的Illumina测序仪,常规模式只能测PE150的长度,靠着软件算法上的进步才得以可用。由此三代测序走上了历史舞台。
3、以illumina HiSeq和MiSeq为代表的二代测序势头强劲,主打低成本和高通量,2017新机型NovaSeq更宣称已将测序成本降至百美金。
4、随后的三代测序技术以高通量为共同特征,也被称为“新一代测序技术(NGS)”。Roche公司的454测序平台、Illumina公司的Solexa测序系统以及ABI公司的SOLID测序系统标志着第二代测序技术诞生。
高通量测序主要是干什么用的
对有参考序列的物种,进行全基因组重测序(resequencing),在全基因组水平上扫描并检测突变位点,发现个体差异的分子基础。在转录组水平上进行全转录组测序,从而开展可变剪接、编码序列单核苷酸多态性(cSNP)等研究。
首先,高通量测序技术具有灵敏度高、检测速度快、半定量等特点,为临床诊断提供了替代性、高效的方法,用于检测耐药基因突变。
目前常说的高通量测序是指用第二代测序技术来进行测序 第三代测序技术(单分子测下),读长较长,错误率较高,成本较高。
高通量基因测序检查俗称无创DNA,即抽取孕妇静脉血,进行胎儿染色体的检查,目前进行该项检查的孕妇数目逐渐增多。无创DNA检查具有一定的适应症,符合适应症的孕妇需遵医嘱进行检查。
二代测序又称为高通量测序(High-throughput sequencing),是基于PCR和基因芯片发展而来的DNA测序技术。关于二代测序的临床应用:二代测序作为一种检测手段,主要应用于基因的生殖变异(遗传性)与体细胞变异(获得性)的检测。
高通量测序技术及原理介绍
高通量测序原理是将基因组DNA片断化,然后克隆到质粒载体上,再转化大肠杆菌。对于每个测序反应,挑出单克隆,并纯化质粒DNA。
测序方案建立在双脱氧测序法(Sanger等,1977)的基础上。为了从每一克隆插入片段两端成对地进行测序,每一个质粒模板DNA板应配备两个384孔循环测序反应板。
二代测序又称为高通量测序(High-throughput sequencing),是基于PCR和基因芯片发展而来的DNA测序技术。关于二代测序的临床应用:二代测序作为一种检测手段,主要应用于基因的生殖变异(遗传性)与体细胞变异(获得性)的检测。
第二代测序(Next-generation sequencing,NGS)又称为高通量测序(High-throughput sequencing),是基于PCR和基因芯片发展而来的DNA测序技术。
Solexa测序技术前世今生(——Illumina平台)Solexa高通量测序技术是由英国剑桥大学派生的Solexa公司建立起来的。该方法以单分子阵列技术为基础,是对合成测序技术的发展与延伸。
测序原理:X-ten与Nova6000测序原理均是基于solexa的边合成边测序的原理;Nova6000采用Illumina的EX-AMP簇生成技术,以及新一代的Patterned Flow Cell。
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